Contudo, o ministro da educação, Fernando Adad fez um pronunciamento nesta terça-feira (29/11), informando que algumas Faculdades da Bahia tiveram 365 vagas dos cursos de enfermagem e farmácia cortadas, mediante medida que faz parte do processo de supervisão pelo qual passarão as graduações que obtiveram notas 1 ou 2, em uma escala de 0 a 5, no Conceito Preliminar de Curso da avaliação 2009/2010, indicador que afere a qualidade da oferta do ensino.
Embora, mega 2550 o ministro tenha incluído a FACISA na sua lista, o Diário Oficial da União, desta terça-feira, dia 29 de novembro de 2011, na sua página 20, não prevê redução de vagas do curso de Enfermagem na FACISA (onde diz que a redução do curso de enfermagem da FACISA é zero), justamente porque o MEC teria considerado o recurso da instituição diante da sua nova estrutura física, técnica e política educacional. O diretor Jackson Cordeiro salienta que todos os cursos de enfermagem da FACISA são reconhecidos pelo MEC, e que inclusive, o curso de enfermagem foi totalmente reestruturado e reequipado, mantendo o nível de um dos mais requisitados cursos da área de saúde da região em razão do oferecimento da sua infra-estrutura, tanto técnico, quanto na docência superior.